По умолчанию CodeIgniter работает с указанием index.php в URL страницы. Это обусловлено тем, что файл index.php реализует задачу инициализации приложения и подключения основных библиотек ядра CodeIgniter. Но можно убрать index.php из URL, используя файл .htaccess с несколькими простыми правилами и небольшими изменениями в файле application/config/config.php.

В БД есть два варианта статей — полный (body) и краткий вариант (description). Для того, что бы для последней статьи выводился description, надо сделать проверку: первая ли это страница и первая ли это статья на странице. т.е. если страница номер 1 и номер массива по порядку 0, то это последняя запись